关于琼脂糖电泳(琼脂糖电泳原理) 的知识大家了解吗?以下就是小编整理的关于琼脂糖电泳(琼脂糖电泳原理) 的介绍,希望可以给到大家一些参考,一起来了解下吧!
今天和大家分享一些关于琼脂糖电泳(琼脂糖电泳原理)的问题。以下是小编对这个问题的总结。让我们看一看。
一、琼脂糖凝胶电泳的原理是什么?
(相关资料图)
琼脂糖凝胶电泳是一种以琼脂糖为介质,分离不同大小的DNA或RNA的电泳方法。琼脂糖是一种多糖,亲水但不带电。
在碱性条件下,DNA带负电(pH8.0缓冲液),在电流的作用下,以琼脂糖凝胶为介质,从负极向正极移动。根据不同DNA分子片段的大小和形状,在电场中的游动速度也不同。同时,在样品中加入染料,可以与DNA分子形成复合物,紫外线照射后可以看到DNA的位置,从而达到分离鉴定的目的。
关于琼脂糖凝胶电泳的笔记
底板一定要用胶带封好,不然倒胶的时候凝胶会漏出来。灌胶时,在交接处倒少量凝胶,用凝固的凝胶密封严密。
梳子切不可插入底部,离底部1-2mm为宜,否则拔出梳子容易破胶,造成漏胶。加热时要注意不要让琼脂糖煮得太厉害,只要稍微煮一下,直到溶液凉了,也就是可以完全溶解。过度沸腾会导致实际凝胶浓度的增加。
放入电泳槽时注意凝胶的极性,不要正负极接反。注意撕掉两端的密封带。凝胶的浓度与要分离的DNA的大小有关。一般浓度为1%,浓度低的胶特别脆。注意一下。
二。琼脂糖凝胶电泳原理
三。琼脂糖凝胶电泳原理琼脂糖凝胶电泳原理简介
四。琼脂糖凝胶电泳的原理是什么
琼脂糖凝胶电泳原理:琼脂糖凝胶电泳是分离和鉴定DNA和RNA分子混合物的常用方法。这种电泳方法以琼脂糖凝胶为支持物,利用DNA分子在游动过程中的电荷效应和分子筛效应,达到分离混合物的目的。
DNA在高于其等电点的溶液中带负电荷,并在电场中移动到阳极。在一定的电场强度下,DNA分子的迁移速度取决于分子筛效应,即分子本身的大小和构型是主要影响因素。DNA的迁移速度与其相对分子量成反比。
不同构型的DNA分子迁移速度不同。例如,一个环状DNA分子样品,其中有三种分子构型:共价闭合环状超螺旋分子(cccDNA)、开环分子(ocDNA)和线性DNA分子(IDNA)。这三种不同构型的分子在电泳中的迁移速度为CCCNA > IDNA > OCDNA。
核酸是两性解离分子,pH3.5是碱基上的氨基解离,三个磷酸基团中只有一个磷酸解离,所以分子带正电,在电场中向负极游去;而在pH8.0-8.3时,碱基几乎不离解,磷酸基团离解,所以核酸分子带负电,在电场中向正极迁移。
不同核酸分子的电荷密度大致相同,所以对游泳速度影响不大。在中性或碱性条件下,单链DNA和等长双链DNA的游动速率大致相同。
扩展数据
影响核酸分子流动性的因素
1.样品的物理性质
即分子的大小、电荷数、粒子形状和空之间的构型。一般来说,电荷密度越大,游动速率越大。而不同核酸分子的电荷密度大致相同,所以对迁移率的影响并不明显。
对于线性分子,分子量的常用对数与迁移率成反比。该标准样品用于电泳并测定其迁移率,然后以DNA分子长度(BP)-迁移距离的负对数作为标准曲线,可用于测定未知分子的长度。
DNA的空构型对迁移率影响很大,比如质粒分子。迁移率的顺序为cDNA > cDNA>IDNA>ocDNA。但由于琼脂糖浓度、电场强度、离子强度和溴化乙锭的影响,会出现相反的情况。
2.支持介质
核酸电泳通常使用琼脂糖凝胶和聚丙烯酰胺凝胶两种介质。琼脂糖是一种聚合物链状分子。含有不同浓度琼脂糖的凝胶组成的分子筛具有不同的筛孔大小,用于分离不同浓度范围的核酸分子。聚丙烯酰胺凝胶是由丙烯酰胺(Acr)在N,N,N′-四甲撑四胺(TEMED)和过 *** 铵(AP)的催化下聚合形成长链,再用交联剂N,N′-亚甲基双丙烯酰胺(Bis)交联而成。筛目尺寸由Acr与Bis的相对比例决定。
琼脂糖凝胶适用于长度为100到60的分子的分离,而聚丙烯酰胺凝胶对小片段(5bp-500bp)的分离效果更好。通过选择不同浓度的凝胶可以分离不同大小的DNA分子。
3.电场强度
电场强度越大,带点的粒子游动越快。而凝胶的有效分离范围随着电压的升高而减小,所以电泳一般采用低电压,小于4V/cm。对于大片段电泳,甚至使用0.5-1.0V/cm电泳过夜。只有聚丙烯酰胺凝胶可以用于高压电泳。
4.缓冲溶液的离子强度
核酸电泳中常用三种缓冲体系,TAE、TBE和TPE,但它们各有优缺点。TAE便宜,但缓冲能力低,需要循环双极缓冲。TPE回收DNA时,会使DNA污染磷酸盐,影响后续反应。因此,经常使用缓冲剂。
在缓冲液中加入EDTA可以螯合二价离子,抑制DNA酶,保护DNA。
缓冲液的pH值通常为碱性或中性,此时核酸分子带负电荷,并向正极移动。
溴化乙锭EB常用于核酸电泳。溴化乙锭是一种扁平分子,可以嵌入双链核酸的成对碱基之间。当BE-DNA复合物被紫外线照射时,出现不同的效应。
254nm紫外线照射时灵敏度更高,但对DNA的损伤严重。用360nm紫外线照射时,灵敏度较低,但对DNA的损伤较小,适用于DNA样品的观察和回收。300nm紫外辐射灵敏度高,对DNA损伤小,所以也适用。
用溴化乙锭对DNA样品进行染色,可在凝胶中加入终浓度为0.5μg/ml的EB。当EB混入DNA分子时,在电泳过程中随时可以观察到核酸的迁移。然而,如果要确定核酸分子的大小,则不应使用上述方法。而是在电泳后将凝胶浸泡在含0.5μg/mlEB的溶液中10 ~ 30 min进行染色。遇光分解,应在4℃避光保存。
参考:百度百科-琼脂糖凝胶电泳
参考:百度百科-凝胶电泳
以上小编对琼脂糖电泳(琼脂糖电泳原理)及相关问题的回答就是这样。希望琼脂糖电泳的问题(琼脂糖电泳原理)对你有用!
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